由于宇智波祭的存在，“晓”组织面对着比火影原著同剧情时期更为强大的敌人。因此，在和宇智波祭争斗基本没有胜算的前提下，宇智波带土打算先休养生息几年，等到三尾复活、“晓”组织战力得到补充后，再同宇智波祭决一高下。
……
时间的指针转动的很快。
一眨眼，五年的时间过去了。
五年时间里，宇智波祭将木叶治理的井井有条。木叶的上上下下，对宇智波祭的评价也都趋于乐观。
木叶60年。
五年的时间过去了，鸣人和佐助已经顺利通过了忍者学校的毕业考试，和火影原著剧情一样，分到了拷贝忍者卡卡西的队伍里。和原著剧情略微有些不同的是，由于猿飞阿斯玛调任火影护卫队副队长，宇智波祭只能派遣无所事事的秋道丁座训练新一代“猪鹿蝶”。
另外，在大蛇丸死后，宇智波祭曾深入大蛇丸遍布忍界的几个秘密基地，杀死以君麻吕为首的“音忍五人众”的同时，宇智波祭还救出了被大蛇丸关押起来的重吾和香磷（由于鬼灯满月没有死，因此，鬼灯水月摆脱了被大蛇丸捕捉的命运）。
只不过，在大蛇丸的秘密基地里，宇智波祭并没有看到药师兜的身影。但令宇智波祭感到兴奋的是，大蛇丸关于“秽土转生”方面的研究资料一个没少，全都被宇智波祭拿到了。
“很多事情，我们不方便亲自去做。如此一来，只有麻烦那些秽土转生出来的强者了。”宇智波祭搓了搓手，兴奋地对着照美冥说道。
在宇智波祭的计划里，秽土转生的强者将代替宇智波祭做很多宇智波祭不方便去做的事情。而这些被秽土转生的人选，宇智波祭也已经选好，并搜集到他们的组织细胞了。
……
高山之巅。
云隐村。
“不好了，雷影大人！”一名云忍冒冒失失闯进了雷影办公室，丝毫没有注意到四代雷影艾脸上愤怒的表情。
“什么事情？”艾强压内心的怒火，冷声向这名云忍问道。
“奇拉比大人被‘晓’组织的干柿鬼鲛和角都抓走了！”这个云忍单膝跪地，焦急地说道。
“你说什么？！”四代雷影艾暴躁地从办公椅上跳了起来，一掌将眼前的办公桌拍的粉碎。
“给我联系雷之国大名，通知其他四个忍村的影，我要立即召开‘五影会议’！”四代雷影艾紧咬牙关，恶狠狠地吼道。